找回密码
 立即注册

QQ登录

只需一步,快速开始

  • QQ空间
  • 回复
  • 收藏

新冠病毒突变株盘点

归去来兮 2021-7-8 02:06 PM 2357人围观 杂谈



近期,新冠德尔塔变异株在世界各地肆虐,今天我们就来盘点一下新冠各个变异株。


世卫组织把新冠的病毒变异株分成了两类,高度关注的变异株和需关注的变异株,其英文分别为Variants of Concern (VOCs)和Variants of Interest (VOIs)。



高度关注的变异株

Variants of Concern (VOCs)

当一种需关注的变异株,同时被证明其与以下一个或多个具有全球公共卫生意义的变化有关时,该变异株为高度关注变异株。

1)该病毒株的传播能力增强;或

2)导致疾病更严重或其它临床疾病表现的变化;或

3)降低公共卫生、措施或现有诊断方法、疫苗、治疗方法的有效性。

需关注的变异株

Variants of Interest (VOIs)

和标准参考株相比,VOI的基因组变异有已经确定或者怀疑的表型突变,并且:

1)已被确认导致社区传播/多个COVID-19病例/群,或在多个国家被检测到;或

2)经世卫组织与世卫组织SARS-CoV-2病毒进化工作组协商,被评估为VOI。

截止2021.6.15,世卫组织归类为VOCS有四株,分别是Alpha、Beta、Gamma、Delta;归类为VOIS有7株,分别是Epsilon、Zeta、Eta、Theta、lota、Kappa、Lambda。


下面重点了解下4株VOCS。


Alpha变异株

  • 名称:B.1.1.7【GR/501Y.V1、20I(V1)】

  • 最早2020年9月在英国发现病例,2020.12.18确认;

  • 刺突蛋白突变: 69del, 70del, 144del, (E484K*), (S494P*), N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H (K1191N*)

  • 对传染性、致病力和免疫逃逸能力的影响:

  1. 传播率增加约50% ;

  2. 根据住院率和病死率的报道,感染后重症的概率升高。

  3. 对使用EUA(Emergency Use Authorizations)单克隆抗体治疗没有影响 。

  4. 对处于康复期患者和疫苗接种后人群,没有影响 。


Beta变异株

  • 名称#:B.1.351【GH/501Y.V2、20H(V2)】

  • 最早2020年5月在南非发现病例,2020.12.18确认

  • 刺突蛋白突变: D80A, D215G, 241del, 242del, 243del, K417N, E484K, N501Y, D614G, A701V

  • 对传染性、致病力和免疫逃逸能力的影响:

  1. 传播率增加约50% 。

  2. 对使用Bamlanivimab和Etesevimab单克隆抗体联合治疗的敏感性明显降低,对其它EUA抗体治疗方法无影响。

  3. 降低处于康复期的患者和疫苗接种后血清中中和抗体的保护作用。

Gamma变异株

  • 名称:P.1【GR/501Y.V3、20J(V3)】

  • 最早2020年11月在巴西发现病例,2021.1.11确认;

  • 刺突蛋白突变: L18F, T20N, P26S, D138Y, R190S, K417T, E484K, N501Y, D614G, H655Y, T1027I

  • 对传染性、致病力和免疫逃逸能力的影响:

  1. 对使用Bamlanivimab和Etesevimab单克隆抗体联合治疗的敏感性明显降低,对其它EUA抗体治疗方法无影响。

  2. 降低处于康复期的患者和疫苗接种后血清中中和抗体的保护作用。


Delta变异株

  • 名称:B.1.617.2 【G/478K.V1、21A】

  • 最早2020年10月在印度发现病例,2021.4.4确认为VOI,2021.5.11确认为VOC;

  • 刺突蛋白突变:T19R, (G142D*), 156del, 157del, R158G, L452R, T478K, D614G, P681R, D950N

  • 对传染性、致病力和免疫逃逸能力的影响:

  1. 病毒的传染性增加,比Alpha的传播性高约60%。

  2. 一些EUA单克隆抗体治疗会失去效果。

  3. 存在降低疫苗接种效果的可能。 


需要注意的是美国疾病控制中心对VOCs和VOIs的定义和世卫组织不同,美国CDC定义的VOCs除了世卫组织确认的4株外,还增加了Epsilon这一变异株。

#:名称分别来源于Pango Lineage【GISAID clade/lineageNextstrain clade】

*:并非在所有序列中检出该突变




References:

1.https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/

2.https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/variants/variant-info.html#Interest

3.https://www.nature.com/articles/d41586-021-01696-3


来源: 木子斋
我有话说......