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科普 | 你知道“酶”,每天都在做什么吗?

归去来兮 2021-5-24 04:33 PM 1592人围观 科普

什么是酶?

ABOUT ENZYME

在任意一个活着的细胞内,每分每秒都发生着成千上万个化学反应。这些化学反应的进行都依赖于酶。


酶是一种起着催化剂作用的蛋白质,它发起、加速这些化学反应,并确保这些化学反应的结果一致。多种酶通常分工合作,组成更长的代谢途径。这里以三羧酸循环为例,三羧酸循环是一系列的化学反应,细胞通过这些化学反应从碳水化合物中获取能量。


基本的生命活动,例如新陈代谢、蛋白质合成以及细胞的更新和生长,均受到酶的调控。


酶催化化学反应

ABOUT ENZYME

酶之所以在生命活动中具有至关重要的作用,是因为它们能在温和的酸碱度、温度和气压下催化化学反应。

在酶的催化作用下,化学反应的速率,要比未被催化的反应快上成万上亿倍。在没有酶的情况下,想要加快化学反应的速率,就需要提供更多的能量以提高温度,加快底物粒子的摩尔运动速度,使粒子之间的相互撞击增多。这些撞击时而能产生足够的能量诱发分子间的化学反应,大多数反应的过程中会形成一种不稳定的中间高能产物。


在化学反应中,酶充当反应的模子,与底物相结合,并将底物保持在合适的位置,组成反应产物。酶也用活性基团包围底物,稳定反应过程中的中间高能产物,使反应的过程更加顺利。


酶的工作原理

ABOUT ENZYME

要想理解酶的工作原理,让我们仔细观察一下三羧酸循环中,由顺乌头酸酶催化的反应。


顺乌头酸酶与其底物柠檬酸根相结合,移除柠檬酸根分子中的羟基与一个氢原子,并形成中间产物:顺乌头酸。随后,顺乌头酸酶又将羟基与氢原子,安装在了略微不同的位置上,形成了反应产物—异柠檬酸根。


在酶的活性部位,一些氨基酸被安排在适合的位置上,用于识别底物,并将其保持在最佳的位置,使反应得以开始。


一些氨基酸参与,识别并固定底物;其它氨基酸则直接参与催化作用,组氨酸101通过放弃它的氢离子来形成酸。

得益于丝氨酸642的化学环境,它可以充当碱来接收来自于底物的氢离子。

顺乌头酸酶的活性部位,还包含了一个铁硫簇,它可以使底物静电稳定,并将其置于催化残基附近。


反应的第一步是脱水,在这一步过程中,组氨酸脱去氢离子,与底物中的羟基相结合,结合成水分子的形式脱去。然后,丝氨酸起到类似碱的作用,自底物的另一边,提取出一个氢原子,组成了中间产物—顺乌头酸。随后顺乌头酸上下翻转,进行相应的水化反应。在这个阶段,组氨酸从路过的水分子处,得到一个氢原子,并将生成的羟基,还给底物。随后丝氨酸分子交还它的氢原子,并释放最终产物异柠檬酸根。


值得注意的是,在这个反应过程中,酶本身没有发生变化。它先获得,随后又交还了一个羟基和一个氢原子,反应的开始与结束时均处于相同的状态。这是催化剂的标志性特点。当它完成一个催化反应后,就已经做好参与下一个反应的准备,因此它可以连续参与成千上万次的反应。


另一个需要注意的点是,活性部位的形状通常是可变的。很多酶包裹其底物,并使其封闭于完美的反应环境。


结语

ABOUT ENZYME

酶对于地球上的生命不可或缺,它每分每秒都在不停工作,以维持地球上每个生命、每个细胞的正常生命活动。


来源: 开发与验证
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