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唾液检测,呼吸道疾病快速检测的新样本突破口

归去来兮 2024-5-13 05:52 PM 235人围观 杂谈

今天,我们发一篇IVD行业的海外热点文章,希望对你有所启发。

以下是这篇热点文章正文。

唾液作为一种分子诊断检测样本类型,对于SARS-CoV-2以外的传染病,如猴痘和流感,展现出了巨大潜力。

这一研究结果在本周举行的欧洲临床微生物学和传染病学会全球大会(ESCMID Global)上提出。

此外,在一次专家见面会上,研究人员主张加强对唾液在传染病诊断中的探索和使用,他们指出,与更成熟的方法相比,唾液作为大规模筛查和世界资源有限地区的样本类型的潜力,要大于其被感知的缺点——例如较低的灵敏度和样本处理及运输问题。

在ESCMID Global的海报展示中,由耶鲁大学全球健康研究所的流行病学研究科学家兼教员Anne Wyllie领导的研究人员,展示了对30个来自猴痘阳性个体的唾液样本进行测试的结果——该研究去年也发表【1】在MedRxiv上。

Wyllie因之前对SalivaDirect COVID-19测试的开发做出贡献而闻名,这是最早获得美国食品药品监督管理局(FDA)紧急使用授权(EUA)的基于唾液的COVID-19测定之一。

在他们的研究中,Wyllie和同事们从Flow Health收集了Spectrum SDNA-100收集装置中的样本,并用五种不同的PCR测定进行了测试。

他们还检查了在各种模拟运输和储存条件下样本的稳定性。

正如他们在海报中解释的,猴痘的当前临床诊断使用病变拭子,但许多患者在病变发作前就出现了症状。

作为美国疾病控制与预防中心认可的传播源,唾液可能有助于早期感染检测,以便快速进行接触后疫苗接种和隔离。

他们发现,由美国公司Co-Diagnostics开发的Logix Smart Mpox (2-Gene) RUO测定法,针对病毒F8L基因,整体检测性能更好,在所有测定类型中平均循环阈值(Ct)值一致。

此外,唾液中猴痘病毒的检测在三种不同的无提取工作流程中具有可比性,并且在多种条件下,DNA在原始唾液中相对稳定,可持续24至48小时,而在72小时时显著降解。

他们得出结论,他们的研究结果支持使用唾液样本可靠地诊断猴痘样本,降低测试成本,并在中低收入国家实现更简单、更便宜的自我收集和测试。

同时,内布拉斯加大学医学中心(UNMC)的研究人员展示了一项研究的结果,该研究检查了自收集唾液样本和无提取PCR在流感监测中的效用,这是基于之前发表在2021年JAMA Network Open上的一些相同研究人员的研究【2】,后者评估了一个公立学校区的SARS-CoV-2筛查和环境监测。

他们从急诊科评估呼吸道疾病的73名患者中收集唾液,作为被动滴漏,比较使用鼻咽(NP)拭子进行商业多重分子板测试的临床呼吸病原体测试的流感检测。

他们还对2022年11月至2023年3月针对无症状个体的社区基础监测项目中剩余的自收集唾液样本进行了无提取测试。

UNMC研究人员发现,使用提取自由RT-qPCR在滴漏样本中随时间检测流感,与NP参考测试的一致性达到100%,其中有5名阳性和68名阴性患者。

此外,研究人员发现,社区基础监测项目的月阳性率从零到近3%不等。

改变观念

在COVID-19大流行期间,唾液作为一种传染病分子诊断(MDx)测试的样本类型取得了进展,但尚未提升为与鼻咽拭子PCR测试的黄金标准相提并论。

在专家见面会上,Wyllie与利物浦热带医学院的博士后研究员Rachel Louise Byrne一起,她也曾广泛研究唾液作为SARS-CoV-2检测的NP拭子的替代样本类型。

Wyllie和Byrne指出了来自不同利益相关者的唾液样本的常见感知问题。

临床医生经常引用性能较差、临床价值有限、保险报销问题以及改变医生常规的困难。

与此同时,临床实验室经常抱怨运输问题、难以处理的样本、低灵敏度和特异性以及有限的市场价值。

尽管如此,自2021年以来,基于唾液的诊断市场在传染病应用方面的增长速度,比内分泌学、心脏病学、自身免疫测试和肿瘤学等其他几个医学测试类别要快,预计到2026年将保持近8%的复合年增长率,Wyllie指出,引用了研究咨询公司PreScouter的微生物学技术总监Maikel Boot提供的数据。

“进入唾液领域的时机已经成熟,”Wyllie说。

此外,Wyllie和Byrne认为,唾液检测的潜在优势值得打破围绕它的一些先入之见。

它非常适合大规模和重复测试,而且不需要医疗保健工作者进行收集,从而降低了传播风险。

此外,尽管NP拭子相对无创,但很明显,向管子里滴口水是一种更舒适的收集程序。

此外,越来越多的研究挑战了围绕唾液检测的许多负面看法。

Wyllie是2020年4月在MedRxiv上发表的一篇开创性论文【3】的通讯作者,该论文证明了唾液对SARS-CoV-2检测比NP拭子更敏感,该工作后来在当年晚些时候发表在《新英格兰医学杂志》的通信【4】中进行了总结。

与此同时,Byrne是2023年1月在PLOS One上发表的一篇论文【5】的共同通讯作者,该论文展示了如何成功利用唾液采样进行医疗保健工作者的常规筛查。

她还是一位研究信函【6】的第一作者,该信函于2020年11月发表在《新发传染病》上,显示了110名患者唾液样本中SARS-CoV-2病毒载量与鼻咽拭子样本中发现的病毒载量相似。

还有许多其他同行评审出版物展示了唾液在SARS-CoV-2和其他呼吸道病毒(包括呼吸道合胞病毒、人副流感病毒、人偏肺病毒、人鼻病毒、流感和腺病毒)MDx测试中的潜力。

欧盟监管机构已经跟进了这些文献,为罗氏、Becton Dickinson/CerTest Biotec和Canary Molecular等公司的基于唾液的COVID-19诊断测试应用了CE-IVD标记。

然而,FDA仍然有些不信服,已经向几种基于唾液的诊断授予了EUA,但迄今为止尚未对任何基于唾液的测试授予完全许可——尽管目前尚不清楚提交了多少申请。

Wyllie和Byrne在ESCMID上指出,在医疗保健社区已经习惯于使用NP拭子的情况下,进行基于唾液的分子测试存在困难。

例如,Wyllie指出,使用唾液的测试必须专门为唾液设计——换句话说,使用与NP拭子相同的协议可能会损害基于唾液的测试性能。

此外,一致地收集质量良好的唾液样本可能更加困难,这对于测试性能至关重要。

如果使用正确的技术,NP拭子通常是一致的,但唾液样本可能会因患者提供样本的指示方式而大不相同——更喜欢被动滴漏而不是“吐痰”。

“良好的唾液样本对良好的测试至关重要。”,Byrne说,“样本应该是清澈到白色的颜色。有时它会含有痰,例如,当没有给出清晰的指示时,可能会发生这种情况。对于住院患者来说,收集样本可能很困难,因为他们可能是干燥和脱水的。但对于门诊患者来说,它可以是一个非常有前景的样本类型。”

这是Wyllie和同事们在2020年与耶鲁大学SalivaDirect团队合作评估该测试作为COVID-19监测工具的使用时,从NBA收集样本时艰难学到的。

“NBA样本是彩虹的每一种颜色。”,她说。

令人惊讶的是,他们发现最近摄入的食物和饮料对结果影响不大。

粘液和白细胞——即粘液——以及奇怪地,高浓度的高露洁牙膏是唯一始终混淆结果的东西。

唾液检测可能已经得到了公众舆论的支持。

消费者已经习惯了所谓的“唾液套件”,这是多年来由23andMe等消费者基因组学公司提供的,而在12月,SalivaDirect团队在MedRxiv上发表了一项调查结果【7】,表明如果他们能够确保所有样本类型对SARS-CoV-2测试的性能相等,消费者压倒性地更愿意选择唾液作为样本类型。

Wyllie承认:“但我们知道并非每个人都会接受它——向管子里滴口水不太有尊严,而且有些药物会导致口干,特别是在老年人口中。”

“我们需要考虑它可以促进快速和容易测试的情景。至少我们需要将其验证为另一种工具,当NP拭子有问题时,或者,例如,当患者不想这样做时,就像一些父母对他们的孩子进行RSV测试时看到的那样。”

鉴于其在资源有限的环境中作为样本类型的潜力,“我禁不住想到结核病,”Byrne说,他引用了2023年9月在《柳叶刀微生物》上发表的一篇综述【8】,该综述讨论了多种替代样本类型(包括唾液)与痰液进行培养和核酸扩增测试的准确性。

尽管关于唾液样本的数据有限,但口腔拭子已被证明是作为替代样本类型的有前景的选择,而且“如果你正在进行口腔拭子,你基本上是在收集唾液,希望在未来几年我们会看到更多的数据。”


[1]    https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.06.12.23291295v1
[2]    https://jamanetwork.com/journals/jamanetworkopen/fullarticle/2784428
[3]    https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.16.20067835v1
[4]    https://www.nejm.org/doi/10.1056/NEJMc2016359
[5]    https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0280908
[6]    https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/26/11/20-3283_article
[7]    https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.12.13.23299858v1
[8]    https://www.thelancet.com/journals/lanmic/article/PIIS2666-5247(23)00190-8/fulltext


来源: 检验科学
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