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不明原因肝病诊断的利器—外显子组测序

面气灵 2019-4-28 09:35 AM 1222人围观 医学


新的研究表明,外显子组测序可以在部分患有不明原因肝病的成年患者中发现与诊断相关的突变。


近日,耶鲁大学医学院和密歇根大学的研究人员在《肝脏学杂志》上发表了一项研究,他们对19名肝病患者进行了基于深度表型和外显子序列的分析,结果显示,这些患者的肝病类型无法用已知的突变或疾病病情来解释。在其中5例特发性肝病病例中,外显子组测序数据通过揭示4种单基因疾病促使这些研究者做出了诊断。
 
耶鲁大学内科和病理学部的研究人员认为WES检测提供的数据加强患有未知原因肝病的患者以及那些患有其他疾病或身体出现非正常临床症状的患者的诊断和管理。
 
2015年10月至2018年8月,耶鲁大学招募了19名患有不明原因肝病,但没有酗酒史的患者。研究人员使用Illumina仪器对他们基因组的蛋白质编码部分进行了测序。研究人员指出,这些被诊断出存在肝脏问题的患者,年龄介于22岁至73岁之间,其中一些患者同时患有其他疾病。
 
除了与人类参考基因组进行比较来识别变异外,该团队还依赖于一个具有专利的深度标准化读取程序来获取外显子组的突变拷贝数。这些数据共诊断除了5名24至33岁的亚洲、欧洲或非洲裔的患有四种不同的单基因疾病的患者。
 
研究人员解释说,追踪这些变化不仅有助于诊断此次研究人群中的部分病例,还为肝病生物学、与多种突变相关的临床表现以及受影响个体的潜在治疗途径提供了新的见解。
 
例如,在一名肝病患者身上,研究小组发现了影响PPARG基因的杂合突变——一种与3型家族性部分脂肪萎缩有关的突变——这就可以让研究人员采用瘦蛋白替代疗法改善该患者的一些症状。
 
研究人员还在两个受影响的个体身上发现了能导致编码多药耐药蛋白3的ABCB4基因的隐性突变,这种突变能导致该蛋白缺乏。在最后两例患者中,外显子组数据分别指向导致的非酒精性脂肪性肝炎和肝脂肪变性的纯合子NDUFB3和杂合子APOB基因变异。
 
基于上述发现,作者提出, 有没有可能存在一个在患有不明原因肝病的同时患有孟德尔疾病的成年患者亚群体。这样的群体在童年期只能通过基因检测才能发现。
 
梅奥诊所(Mayo Clinic)的两名研究人员在《肝脏学杂志》(Journal of liver ology)发表的一篇相关社论中表示,这项研究“强调了WES试验对成年患者进行孟德尔病诊断的重要性,这些患者患有无法解释的肝病,甚至没有家族病史。”
 
这篇社论的作者Filippo Pinto e Vairo和Konstantinos Lazaridis指出,新确诊的患者都不到40岁,这表明外显子组测序方法可能对年轻患者更加有好处。
 
基于这项新研究和之前发表的研究结果,这两名研究者认为,提倡在临床中对患有特发性肝病的成年患者使用WES检测,但保留一项建议,即对40岁前的出现疾病症状或体征的患者采用该检测


原作者: 佟晓宁 来源: 临床实验室
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