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通过国内外仪器的性能比对,竟能发高分SCI文章!

归去来兮 2023-12-8 04:16 PM 399人围观 技术


近日,在查阅资料时一篇文献引起了笔者注意。奥地利格拉茨医科大学最近在Journal of Clinical Microbiology(IF=9.4)发表了一篇文章,题目为“A head-to-head comparison of three MALDI-TOF mass spectrometry systems with 16S rRNA gene sequencing”。

该文章评估了MALDI Biotyper (Bruker ) 、EXS 2600(Zybio) 、Vitek MS (bioMérieux)三种MALDI-TOF质谱系统的性能,其中Zybio为中国厂家,Bruker和bioMérieux是微生物质谱领域全球知名品牌。


欧美市场主动评估中国产品的情况并不多见,国内质谱数据库会不会在国外“水土不服”,带着对结果的好奇读完了整篇文章。


在文章中,格拉茨医科大学团队提到尽管MALDI-TOF MS在诊断方面非常重要,但欧洲地区可选择的仪器和数据库却很少,仅有Bruker和bioMérieux,Zybio质谱作为新的选择进入该市场崭露头角,在多家教学医院及大型临床实验室使用,遂对三种质谱系统的性能进行了评估。


该团队收集了365株日常临床难以鉴定的细菌,使用三种质谱系统进行平行试验,MALDI Biotyper 、EXS 2600、Vitek MS三种系统的有效检出率分别为98.6%、94.4%和93.3%,其中与测序结果的一致性分别为98.9%, 98.5%和99.7%。结论是三家仪器均能满足临床微生物检验的要求。




实验和方法



所有菌株均来自于格拉茨医科大学,由专业人员进行测试,第一次使用直涂法进行检测,未能鉴定出来,重新制样采集一次,当重新检测也失败时,使用甲酸提取法重新检测。


表1 菌株分类学分布




结  果



由于三个系统对于各自数据库的设计不同,部分菌种鉴定结果有绿色水平(置信度较高)或黄色水平(置信度较低)差异,结果可能显示为单一菌种或多个菌种。


最终结果显示,Biotyper、EXS 2600、Vitek MS三个系统结果为单一菌种的占比分别为91.0%,85.7%,81.7%;三个系统结果为绿色水平的占比分别为92.1%,87.4%,86.8%;三个系统有效检出率的占比分别为98.6%,94.4%,93.3%。


表2 三种MALDI-TOF质谱系统的结果有效率


除单一鉴定结果外,当多个结果中至少有一个种与16S rRNA基因测序结果一致时,MALDI-TOF MS结果也被认为是正确的。最终结果显示,有效检出中Biotyper、EXS 2600、Vitek MS三个系统与16S rRNA基因测序结果的一致性分别为98.9%,98.5%,99.7%。


表3 16S rRNA基因测序与MALDI-TOF质谱测量结果的一致性




讨  论



该团队指出,这是首次将三种MALDI-TOF质谱系统进行平行比较的研究,尽管样本量不大,但该团队特意去关注了一些难鉴定的菌,根据结果来看,三种MALDI-TOF质谱系统都被证明是微生物实验室有价值的鉴定工具,符合临床微生物诊断的要求,看来国产质谱已经很好地解决了菌种鉴定的地域差异问题。


遗憾的是,此次平行对比纳入的菌种并未涉及临床微生物中备受关注的真菌,期待未来能有更多评价中国先进技术的场景,也期待中国技术在国际上继续大放光彩。



奥地利格拉茨医科大学

奥地利格拉茨医科大学成立于2004年,位于奥地利东南施泰尔马克州首府格拉茨市,是奥地利第二大城市。学校建立了众多的研究机构,积极参与重大医学研究项目,教学与科研并重,取得了世界一流的科研成果,其医学专业,在世界排名中位居第100-150位之间。

(http://www.medunigraz.at/)



JCM期刊介绍
Journal of Clinical Microbiology是一本微生物学方向的TOP期刊,创刊于1975年,由American Society for Microbiology出版。期刊现任主编是来自美国马萨诸塞州波士顿儿童医院的Alexander J. McAdam博士。期刊ISSN号:0095-1137,EISSN号:1098-660X。最新影响因子为9.4分。



说明:本文为投稿文章,不代表检验医学新媒体观点,转载时请注明来源。

编辑:唐强虎  审校:方琪


来源: 检验医学
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