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生殖检测最新突破!法国科学家正在研发子宫内膜异位症分子诊断方法 ...

mango524 2023-5-10 07:50 AM 414人围观 医学



一个由巴黎科钦研究所领导的法国团队获得了150万欧元的欧盟资金,用于开发子宫内膜异位症的生物标志物。子宫内膜异位症(endometriosis)是指有活性的内膜细胞种植在子宫内膜以外的位置而形成的一种女性常见妇科疾病。本病多发生于生育年龄的女性。


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克服偏见,在月经液中寻找新的疾病标志物

这个为期五年的项目叫做MensEndoDiag,使用月经血作为样本类型。Ludivine Doridot是科钦研究所研究员、巴黎大学国际研究所副教授:“月经血作为一种样本类型被忽视了,尽管它绝对可以用于分子检测。”


“它被忽视有两个原因,第一个是社会障碍,因为有些人认为这很令人恶心。第二,女性卫生用品直到最近才比较容易地收集经血,可重复使用月经杯改变了这一情况,并使对女性健康感兴趣的研究人员受益。这种样本中有很多活细胞。当你问女性时,她们很乐意把它交给科学。”


MensEndoDiag将进行多种类型的生物标志物研究。首先是将通过二代测序获得的单细胞转录组学数据与蛋白质生物标志物数据相结合,以发现可用于诊断子宫内膜异位症的标志物。研究人员将招募代表不同子宫内膜异位症亚型的患者,上皮、卵巢和深度浸润,并希望使用机器学习工具定义新的亚型。


Doridot指出,研究人员将使用10xGenomics和Illumina平台进行文库构建和RNA测序。


该团队还在考虑使用圣地亚哥生物传奇公司的LegendPlex法来测量定制的蛋白质标记物。LegendPlex是一种基于微珠的免疫分析方法,可以通过流式细胞仪以96孔板的格式读取。


MensEndoDiag的发现队列将包括64名患者,包括病例和对照组,她们均来自科钦医院。研究人员定义了一套标记物,他们就打算在250名女性的月经样本中进行验证。但这还需要一段时间,因为很多女性都在使用避孕药。这使得找到能够提供月经样本的子宫内膜异位症患者更加困难。仅仅组建发现队列就可能需要一年的时间。


研究人员还想开发一组蛋白质和RNA标记物,可用于子宫内膜异位症患者的亚型。Doridot说:“我们希望开发出两者结合的产物。可以很容易地将一种抗体与一个核酸标签联系起来,并且可以同时评估蛋白质和RNA。”


研究人员还将培养含有或不含免疫细胞的月经衍生的类器官,以评估功能变化,并测试新的免疫调节治疗方法。2020年,Doridot和其他研究人员在《Cell Reports》上发表了一篇论文,讨论了小鼠子宫内膜异位细胞对低剂量脂多糖启动的巨噬细胞的反应,并指出研究人员可能使用培养的人类细胞进行类似的研究。


最后,研究人员还致力于确定月经中潜在的生物标志物,以预测独立患者对手术或体外受精治疗的反应。这些标记物可能与用于诊断子宫内膜异位症的标志物相同,研究人员正致力于其共性研究。


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美国国家卫生研究所出资支持

几家公司已经开发或正在开发依赖月经作为样本类型的子宫内膜异位症分子检测。其中一家是NextGen Jane,一家总部位于加州奥克兰的公司,在2022年2月从美国国家卫生研究所获得了150万美元,继续用经血进行子宫内膜异位症的测试研究工作。


此外,去年秋天,总部位于圣地亚哥的Xosomix从美国国家卫生研究所获得了31.8万美元的资金,用于开发一种基于月经血的子宫内膜异位症测试,它依赖于多重定量蛋白质组学。


同样是在去年,Innovative Health Diagnostics和AIMA实验室表示,他们正在开发一种子宫内膜异位症的测试,该方法依赖于microRNA生物标志物检测。


NextGen Jane首席执行官Ridhi Tariyal在一封电子邮件中表示,月经的分泌液提供了一种“独特的混合细胞类型”,包括在任何其他样本类型中都没有的免疫细胞,因为月经是一种激素驱动的炎症反应。她补充说,这些细胞协调月经的过程,在对阴道和环境中发现的细菌和病原体的反应中发挥着重要的作用。


Tariyal同意Doridot的观点,由于上述的社会污名化,这种样本类型在生物标志物的发现和诊断开发方面被忽视了。在早期,我们遇到了实验室是否想要处理月经材料的怀疑态度。考虑到其他脱落材料,如粪便样本,已经被采用用于微生物组检测和结肠直肠癌筛查,这种反应令人惊讶。


尽管如此,临床研究参与者经常发送NextGen Jane卫生棉条进行分析。Tariyal表示,我们认为这是一种肯定,即按照正常程序对样本进行收集,并创建一个优雅的样本收集机制。


月经液作为一种诊断样本也会遇到挑战。例如。月经液中的许多细胞已经死亡或正在死亡的过程中,这使得分离出一个基因表达特征变得更加困难。因为月经是一种免疫反应。在液体中检测到的复杂信号可能掩盖了一种特定的疾病。月经液的含量也每天都在变化,而且在患者之间“变化巨大”。


Tariyal说,对异质性进行正常化需要了解这种样本类型内的生物变化,以及可以解释可变性,并将这些动态信号分层为有意义的数据的生物信息学方法。她承认,在下一代NextGen Jane平台的开发过程中,创建分析这些数据的内部流程将花费最多的时间。但一旦你有了一个复杂的程序,未来对疾病的见解也会是深刻的。



原作者: MIR医学仪器与试剂
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