宏基因组测序病原微生物检测生物信息学分析规范化管理专家共识 ...

序列：文库在高通量测序设备上进行测序，得到的碱基序列称为序列。

读长：序列的读长是影响分析准确度的重要因素，最大读长取决于所选的测序平台。

序列数：通常在检测报告中显示的序列数为该物种属或种特异序列条数。

原始数据：一次测序产生的没有经过任何过滤的全部测序结果称为原始数据。高通量测序下机的原始数据经信号转换后得到含常规碱基（A、T、C、G等）及对应碱基测序质量信息的数据，通常包括接头序列、标签序列、测序数据，以fastq格式存储。

可用数据：可用数据是原始数据经过处理得到的直接用来分析的数据。原始序列数据经质量过滤，去除接头序列、标签序列后，得到的可用于比对的序列称为可用数据，包含人源及微生物序列。

相对丰度：指注释到该物种的序列数占样本中所有微生物总序列数的百分比。

绝对丰度：指注释到该物种的序列数占总数据量的百分比。

基因/基因组覆盖度：指测序获得的序列与某物种的参考基因/基因组进行比对，序列覆盖的区域占基因/基因组总区域的比例。

平均测序深度：将能与基因/基因组比对上的序列碱基数累加并除以基因/基因组被覆盖区域的总长，即为平均测序深度。