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不同患者新冠病毒基因序列几乎相同:柳叶刀最新论文

面气灵 2020-2-2 260人围观 机构

2019-nCoV 很可能是最近才侵染人类并且被相对迅速地检测出来。

该病毒进入人类细胞所使用的分子「通道」可能与严重急性呼吸系统综合症(SARS)病毒相同。


《柳叶刀》1 月 30 日发表一项研究,对取自武汉市 9 名患者的 10 株新型冠状病毒(2019-nCoV)基因组序列进行了新的遗传分析,发现该病毒与两种源自蝙蝠的 SARS 类似冠状病毒的关联最为密切。



作者认为,尽管该分析表明蝙蝠可能是该病毒的原始宿主,但在武汉市华南海鲜市场出售的某一种动物可能是将该病毒传播至人的中间宿主。因此,对该病毒的演变、适应和传播仍亟需进一步调查。


在本研究中,作者报告了 9 名不明原因的病毒性肺炎患者的流行病学数据。通过对患者肺部采集到的细胞和分泌物样本进行提取和培养,获得 2019-nCoV 病毒样本,并对其进行分析以明确病毒的起源和其进入人体细胞的方式。


在这 9 名患者中,有 8 名患者曾去过华南海鲜市场;1 名患者从未去过该市场,但在发病前曾就住于市场附近的一家酒店中。


作者在取自患者的全部 10 份基因样本中均发现了 2019-nCoV,包括 8 个完整基因组和 2 个部分基因组。各样本的基因序列几乎完全相同(超过 99.98% 的基因序列相同),这表明该病毒是最近才侵染人类。


值得关注的是,本研究发现来自不同患者的 2019-nCoV 病毒基因序列几乎相同。这一发现说明,分离得到的 2019-nCoV 起源于同一来源,传播发生的时间还很短,并被相对迅速地检测出来。但是,随着病毒传播给更多的人,对突变的发生进行不断的监测是有必要的」, 该研究的通讯作者之一、山东第一医科大学(山东省医学科学院)、山东省高等学校新发传染病病因流行病学实验室史卫峰教授表示。


将 2019-nCoV 的基因序列与病毒库进行对比,作者发现与其关联最为密切的病毒是源于蝙蝠的两种SARS类似冠状病毒(bat-SL-CoVZC45 和 bat-SL-CoVZXC21) ,共有基因序列达 88%。从遗传学角度来说,2019-nCoV 与人类 SARS 病毒(基因序列相似性约为 79%)和中东呼吸综合征(MERS)病毒(基因序列相似性约为 50%)相差较大。


通过研究该病毒的棘突蛋白(与细胞受体结合并促使侵入人类细胞的病毒表面蛋白),研究人员发现 2019-nCoV 的棘突蛋白与人类 SARS 病毒具有相似的结构,尽管存在一些细微差异。因此,作者提出 2019-nCoV 可能与 SARS 病毒使用相同的分子通道(受体为 ACE2)进入细胞,但这一点仍然需要进一步确认。


根据数据分析,作者指出导致武汉市疫情爆发的 2019-nCoV 最初的宿主可能是蝙蝠,并通过在华南海鲜市场出售的某种目前尚未明确的野生动物传播给人类。


中国疾病预防控制中心武桂珍教授说:「这些数据与蝙蝠携带的冠状病毒库大体一致,特别是 2019-nCoV。尽管蝙蝠在此次传染病流行过程中很重要,但在蝙蝠与人类之间仍然存在其他动物作为中间宿主的可能」。


她解释道:「第一,疫情的首次报告是在 2019 年 12 月下旬,彼时武汉的大多数蝙蝠都在冬眠;第二,在华南海鲜市场上未发现有蝙蝠或出售蝙蝠,但是有许多非水生动物(包括哺乳动物);第三,2019-nCoV 与它的近亲 bat-SL-CoVZC45 和 bat-SL-CoVZXC21 之间的基因序列相似度不到 90%,这意味着这两种源于蝙蝠的冠状病毒并不是 2019-nCoV 的直接祖先;第四,在 SARS 和 MERS 中,蝙蝠都是其自然宿主,另一种动物作为中间宿主,而人类作为最终宿主。这再次说明该病毒在野生动物中存在着未知的中间宿主源并且有可能通过中间宿主传播给人类。」




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截至 2 月 1 日 12 时,全国已确诊新型病毒肺炎患者 11821 例,疑似 17988 例,死亡 259 例,治愈 245 例。



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来自: 柳叶刀 TheLancet
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