当病毒遇见mNGS

在人类的传染病中约75%以上是由病毒感染所引起，在冬季呼吸道传染病中，由病毒引起者占90%以上。病毒性疾病传染性极强，传播速度快，尤其是HIV、SARS和MERS冠状病毒、埃博拉病毒、高致病性禽流感病毒H5N1和H7N9，更甚的是近年来正蔓延流行的H1N1甲型流感病毒都严重威胁人类健康。因此，病毒性疾病的诊断与防治都面临新的挑战。

病毒的分离与鉴定是病毒病原学诊断的金标准，但因病毒是严格细胞内寄生，须在活的易感细胞培养，故病毒的分离鉴定较困难、繁杂，且需时很长，随着分子病毒学的发展，临床上现已不断建立新的快速诊断的方法。

因此，今天小编来讲的就是一种新的方法，基于宏基因组的新一代测序技术术(metagenomics next generationsequencing, mNGS) 不依赖于传统的培养技术，直接对临床样本中的核酸进行高通量测序，然后与数据库进行比对分析，根据比对到的序列信息来判断样本包含的病原微生物种类，能够快速、客观的检测临床样本中的较多病原微生物（包括病毒、细菌、真菌、寄生虫），且无需特异性扩增。

废话不多说，看一看我们的一个case：

患儿男，8岁，因“反复抽搐20余次，昏迷一天”，入院治疗。患儿发病前有感冒症状，表现为鼻阻，流涕，但无发热，咳嗽等。无吐泻，纳可，大小便正常。3天前患儿突然倒地抽搐，表现为强直样发作，双眼凝视，口唇发绀，呼之不应。但无口吐白沫，两便失禁的情况。持续约数分钟后缓解。缓解后便进入昏迷状态。家属立即带患儿到医院诊治，予颅CT，腰穿查脑脊液常规，生化，均正常，在当地于抗感染（具体不详）治疗2天后，病情无缓解，遂转院进一步治疗。通过采集脑脊液进行高通量测序，短短24小时，脑脊液中检测出来均为Human parvovirus  B19 / 人类微小病毒 B19，后与医院培养结果相适应。

在临床上，如果遇到以下几种情况：

1）病情危重需要尽快明确病原体；

2）特殊病人如免疫抑制宿主，合并基础疾病，反复住院的重症感染患者需要尽快明确病原体

3）传统微生物检测技术反复阴性且治疗效果不佳；

4）疑似新发病原体，临床上提示可能有一定的传染性；

5）疑似特殊病原体感染；

6）长期发热和/或伴有其他临床症状，病因不明感染。

符合以上 适应症的患者，应尽快送标本进行检测。